WWF Chile se estableció en 2002 y cuenta con programas de conservación tanto terrestre como marina, en la Patagonia y en todo el país. Además de otros trabajos importantes, WWF Chile trabaja con el sector pesquero para mejorar las prácticas pesqueras a través de etiquetado y certificado y el desarrollo de criterios científicos en la asignación de cuotas de pesca; así como en la planificación marina estratégica del paisaje marino para la creación e implementación exitosa de áreas marinas protegidas. Esto con el objetivo de salvaguardar hábitats críticos para especies carismáticas como la ballena azul, el delfín chileno, el pingüino de Humboldt y el pingüino magallánico, etc.